Fundado em 1866, por iniciativa de intelectuais interessados em estudar a flora e fauna da região. O local teve um importante papel no desenvolvimento das Ciências Naturais no Brasil no século XIX. Ao longo da sua história, passou por várias fases, mas sempre atraindo a atenção de cientistas, pelo trabalho pioneiro que desenvolve na Amazônia e pelo acervo que possui. Em 25 de março de 1871, o Museu Paraense foi instalado oficialmente pelo Governo do Estado, e Domingos Soares Ferreira Penna foi nomeado como seu primeiro diretor. Três foram as fases que lhe deram prestígio: a fase Emílio Goeldi (1895-1021), com vasta produção científica, amparada pelos lucros do auge do Ciclo da Borracha na região; a fase de Carlos Estevão de Oliveira (1930-1945), apoiada pelo então intendente Joaquim Cardoso de Magalhães Barata, que possibilitou grande avanço na pesquisa aplicada sobre animais silvestres e piscicultura, tornando-a de conhecimento público. O Museu Paraense Emílio Goeldi é uma instituição de pesquisa vinculada ao Ministério da Ciência e Tecnologia do Brasil, com objetivo de produzir e difundir conhecimentos e acervos científicos sobre sistemas naturais e sócio-culturais relacionados à Amazônia. Realiza experiências em diversos campos, como em museologia, educação ambiental, editoração, jornalismo, documentação e informação científica, além da manutenção do Parque Zoobotânico, criado em 1895, uma mostra viva da natureza da região que serve de instrução e entretenimento à população e aos que visitavam Belém. Atualmente desenvolve atividades de pesquisa e ensino em biologia, ciências humanas e ciências da Terra, além de possuir um volumoso acervo constituído de coleções nas áreas de arqueologia, antropologia, botânica e zoologia.